Подготовка  на факультете ведется по программе высшего образования по специальности «Кораблевождение и эксплуатация морских средств навигации». Срок обучения 5 лет. По окончании факультета обучения выпускникам присваивается первое офицерское звание «лейтенант» и квалификация «инженер» с выдачей диплома государственного образца

На первичных воинских должностях  – командир электронавигационной группы корабля 1,2-го ранга, командир штурманской боевой части корабля 3-го ранга. Выпускник училища проходит корабельную службу в частях и соединениях военно-морского флота. Регионы службы ограничены расположением военно-морских баз и пунктов базирования кораблей. После приобретения служебного опыта при прохождении службы на первичных офицерских должностях выпускник может замещать последующие офицерские должности без обучения по программам магистратуры: главный штурман ВМФ, начальник кафедры кораблевождения, начальник Управления навигации и океанографии, начальник научного отдела НИИ.

Подготовка  на факультете ведется по программе высшего образования по специальности «Применение и эксплуатация ракетного вооружения надводных кораблей». Срок обучения 5 лет. По окончании факультета обучения выпускникам присваивается первое офицерское звание «лейтенант» и квалификация «инженер» с выдачей диплома государственного образца. На первичных воинских должностях командира батареи (группы) ракетно- артиллерийской боевой части кораблей I-II ранга, командира боевой части кораблей III-IV ранга. Помимо исполнения должностных обязанностей, молодые офицеры допускаются и несут корабельные дежурства и вахты (дежурным по кораблю, вахтенным офицером и т.д.). Выпускники – офицеры ракетчики не только обеспечивают эксплуатацию и боевое применение всех видов ракетного оружия ВМФ, но и занимают ведущие командные должности на флотах ВМФ.

Подготовка  на факультете ведется по программе высшего образования по специальности «Применение и эксплуатация крылатых ракет подводных лодок». Срок обучения 5 лет. По окончании факультета обучения выпускникам присваивается первое офицерское звание «лейтенант» и квалификация «инженер» с выдачей диплома государственного образца. На первичных воинских должностях  – командир группы старта ракетной боевой части подводной лодки, командир группы управления ракетной боевой части подводной лодки, инженер группы управления ракетной боевой части подводной лодки,командир группы целеуказания ракетной боевой части подводной лодки, инженер лаборатории (цеха) подготовки крылатых ракет технической базы вооружения. После прохождения службы на первичной должности «командир ракетной боевой части» выпускник может быть назначен на последующие должности: флагманский специалист ракетного оружия соединения (объединения)– начальник службы ракетно-артиллерийского вооружения флота – начальник службы развития и эксплуатации ракетно-артиллерийского вооружения ВМФ.

Подготовка на  факультете ведется по программам высшего образования по специальности «Применение подразделений специального обеспечения и эксплуатация специальных боеприпасов». Срок обучения 5 лет. По окончании факультета обучения выпускникам присваивается первое офицерское звание «лейтенант» и квалификация «инженер» с выдачей диплома государственного образца, а также водительское удостоверение категории «С». По выпуску из училища молодые офицеры проходят службу в частях 12 ГУ МО РФ (на первичных воинских должностях: старший оператор группы сборки и регламента сборочной бригады, инженер расчета технического контроля разведывательного корабля).

Подготовка на  факультете ведется по программам высшего образования по специальности «Применение и эксплуатация береговых ракетных комплексов и артиллерии». Срок обучения 5 лет. По окончании факультета обучения выпускникам присваивается первое офицерское звание «лейтенант» и квалификация «инженер» с выдачей диплома государственного образца, а также водительское удостоверение категории «С». По выпуску из училища молодые офицеры проходят службу в частях БРАВ ВМФ (на первичных воинских должностях: начальник расчёта пусковой установки (радиотехнической станции, пункта управления), начальник отделения технической батареи).

Подготовка на  факультете ведется по программам высшего образования по специальности «Подводно-технические работы специального назначения». Срок обучения 5 лет. По окончании факультета обучения выпускникам присваивается первое офицерское звание «лейтенант» и квалификация «инженер» с выдачей диплома государственного образца, а также водительское удостоверение категории «С». По выпуску из училища молодые офицеры проходят службу в частях Главного разведывательного управления МО РФ, Разведывательного управления ВМФ и спецподразделений ФСБ РФ (на первичных воинских должностях: командир группы водолазный – специалист специального назначения, командир группы водолазный – специалист борьбы с ПДСС, минер водолазный – специалист).

Подготовка на  факультете ведется по программам высшего образования по специальности «Применение и эксплуатация вооружения и технических систем морских робототехнических комплексов». Срок обучения 5 лет. По окончании факультета обучения выпускникам присваивается первое офицерское звание «лейтенант» и квалификация «инженер» с выдачей диплома государственного образца. это специальность, которая направлена на подготовку высококвалифицированных специалистов, способных проектировать сложные системы с автоматическим и программным управлением, электро-, гидро- и пневмоприводы, робототехнические системы и мехатронные устройства. Особое внимание в процессе обучения уделяется проектированию мобильных роботов и роботов-манипуляторов, работающих без непосредственного участия человека и предназначенных для функционирования в сложных и опасных условиях — в космосе и воздухе, под землёй и под водой, при проведении взрывных работ и работ с вредными и опасными химическими, ядовитыми и радиоактивными веществами.

Подготовка специалистов ведется по программам среднего профессионального образования по специальности «Эксплуатация и ремонт систем управления и стартового оборудования ракетного вооружения надводных кораблей». Срок обучения 2 года 10 месяцев. По окончании обучения выпускникам присваивается воинское звание «мичман» и квалификация «техник» с выдачей диплома государственного образца.

Подготовка специалистов ведется по программам среднего профессионального образования по специальности «Эксплуатация и ремонт береговых ракетных комплексов». Срок обучения 2 года 10 месяцев. По окончании обучения выпускникам присваивается воинское звание «мичман» и квалификация «техник» с выдачей диплома государственного образца.

Подготовка специалистов ведется по программам среднего профессионального образования по специальности «Эксплуатация и ремонт водолазных и глубоководных средств». Срок обучения 2 года 10 месяцев. По окончании обучения выпускникам присваивается воинское звание «мичман» и квалификация «техник-судомеханик»  с выдачей диплома государственного образца.