Факультет «Специального вооружения» проводит подготовку по специальности «Применение подразделений специального обеспечения и эксплуатация специальных боеприпасов сил флота». Гражданская специальность «26.05.04 Применение и эксплуатация технических систем надводных кораблей и подводных лодок» в интересах 12 Главного управления Министерства обороны РФ.
Пройдя путь от Специального отдела Генерального штаба до центрального органа военного управления, 12 Главное управление объединило в единое целое соединения, воинские части, научно-исследовательские учреждения, полигоны, учебные центры и материально-технические базы. Как составная и неотъемлемая часть Министерства обороны Российской Федерации, оно является, по существу, координирующим звеном между корпорацией «Росатомом» и Вооружёнными Силами, обеспечивает эксплуатацию практически всего запаса специальных боеприпасов, изготавливаемых на предприятиях корпорации «Росатом», поставку их во все виды и рода войск Вооружённых Сил.
Во время обучения курсанты овладевают знаниями о комплексах специального оружия, об организации специального обеспечения Вооружённых Сил, устройстве и принципах действия специальных боеприпасов. Большое внимание уделяется отработке практических умений и навыков при выполнении работ по техническому обслуживанию и подготовке к боевому применению специальных боеприпасов.
